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Para que serve O cloridrato de doxiciclina é indicado no tratamento das seguintes infecções: Febre das Montanhas Rochosas, febre tifoide e do grupo tifoide, febre Q, varíola por riquétsia e febre do carrapato causada por Rickettsia; Infecção respiratória causada por Mycoplasma pneumoniae; Psitacose causada por Chlamydia psittaci; Linfogranuloma venéreo causado por Chlamydia trachomatis; Uretrite não complicada, endocervicite ou infecções retais em adultos causadas por Chlamydia trachomatis; Tracoma causado por Chlamydia trachomatis, embora o agente infeccioso não seja sempre eliminado como observado pela imunofluorescência; A conjuntivite de inclusão causada por Chlamydia trachomatis pode ser tratada com cloridrato de doxiciclina oral isolada ou em associação com agentes tópicos; Orquiepididimite aguda, causada por Chlamydia trachomatis ou Neisseria gonorrhoeae; Granuloma inguinal (donovanose) causado por Calymmatobacterium granulomatis; Estágios iniciais (I e II) da doença de Lyme causado por Borrelia burgdorferi; Febre recorrente causada por Borrelia recurrentis transmitida pelo piolho; Febre recorrente causada por Borrelia duttonii transmitida pelo carrapato; Uretrite não gonocócica causada por Ureaplasma urealyticum (micoplasma-T). O cloridrato de doxiciclina também é indicado para o tratamento de infecções causadas pelos seguintes microrganismos Gram-negativos: Acinetobacter spp.; Bacteroides spp.; Fusobacterium spp.; Brucelose causada por Brucella spp. (em associação a estreptomicina); Peste causada por Yersinia pestis;  Tularemia causada por Francisella tularensis; Bartonelose causada por Bartonella bacilliformis; Campylobacter fetus. Uma vez que muitas cepas dos seguintes grupos de microrganismos têm demonstrado serem resistentes às tetraciclinas, recomendam-se testes de suscetibilidade e cultura.